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CrystalMaker 11（日本語PDFマニュアル付）

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HY10APT  Personalライセンス

¥ 149,600 本体価格 ¥ 136,000

HY10APG  Personalライセンス

¥ 149,600 本体価格 ¥ 136,000

製品特徴

結晶学における定番ソフトウェア

結晶や分子構造を最も効果的に可視化します。インタラクティブに設計されたインターフェースを通じて、周囲との関係を考慮しながら特定の部分を操作したり、複雑な物質構造を理解するためのモデルを構築できます。従来の結晶学ソフトウェアの枠を大きく超えて、可視化した結果を動的に操作したり、回転するアニメーションを作成することができます。エネルギーモデリングツールを使って、構造を新規作成してそのエネルギーを最小化 (relax) したり、振動プロパティを予測したり、他の物質との関係を調べることができます。

（左上）アニメーションフレーム ／ （右上）空孔（porosity）の可視化
（左下）エネルギーモデリングの結果 ／ （右下）高温モンテカルロシミュレーション

結晶エネルギーの完全モデリング

CrystalMakerには統合された独自の結晶エネルギーモデリングエンジンが装備されています。コアとなるのは、パラメータ化されたポテンシャルの膨大なライブラリです。プログラムでは、既存の結合基準と原子環境に関する詳細な知識に基づくスマートな選択基準が使用されます。エネルギー最小化では、モンテカルロと最小二乗法によるハイブリッドな手法を使用して、表面を含む緩和をリアルタイムに実行できます。

ペロブスカイト構造をCrystalMaker 11で緩和した例

フォノンエクスプローラ

CrystalMaker 11では、分散曲線と構造アニメーションを含む結晶の振動モードを計算できます。格子波、すなわち「フォノン」は、逆空間の任意の点について可視化できます。逆空間内の任意の 2 点を指定すると、それに対応する分散曲線が表示されます。分散曲線の 1 点をクリックするだけで、波数ベクトルが定義され、その振動モードを可視化できます。

岩塩構造におけるフォノンの光学モードを可視化した例

インポートとエクスポート 約45種類のフォーマットの構造データをインポートして、それらを素早く可視化したりじっくりカスタマイズすることができます。DL_POLY の HISTORY ファイル等、多構造ファイルを取り扱うことができます。同期化機能とアニメーション機能を使えば、構造的な挙動、格子力学を素早く理解したり、シミュレーションの軌道（trajectory）を可視化することができます。塊状（massive）の構造も取り扱うことができます。CrystalMaker 独自の “Depth Profiling” ツールを利用すれば、塊状構造の関心領域を素早くスキャンできます。コンピュータモデルで得られた結果を特徴づけるのに理想的な機能です。

原子環境の探索 CrystalMakerには、原子や結合をマウスでクリックしたり、ロールオーバーするだけで結合距離、角度、ねじれ角といった配位環境をリアルタイムに測定できる操作性の高いスクリーンツールが装備されています。また、半径をリアルタイムに調整しながら配位クラスターやシェルを可視化できます。例えば、球状のナノ粒子もマウスをクリックするだけで作成できます。結合距離と角度の詳細な情報を画面に出力したり、テキストファイルにエクスポートすることができます。パワフルな Distance Explorer を使えば、任意の元素またはサイトの組み合わせについて、その配位環境をグラフィカルに可視化することができます。また、X 線や中性子の２体分布関数（"partial” Pair Distribution Functions）を可視化することもでき、特定の元素対のための「部分」２体分布関数（"partial” Pair Distribution Functions）をオプションで選択できます。 ▶︎動画：Measurement

変換機能と結晶工学 単位胞を変換したり、格子タイプを変更したり、スーパーセルを構築したり、原点を移動したり、任意のマトリクス変換を適用することができます。選択した格子面に単位胞を投影して “surface cell” を作成することも可能です。 選択ツールを使うことで、原子群の移動、切り離し、複製、非表示、削除ができます。分子断片を非表示にしたり修復したり、個々の分子を単離できます。任意の方位の格子面を表示できます。結晶をスライスして表面や内部面を調べたり、ある構造や分子を別の構造や分子に配置できます。CrystalMaker のリアルタイム結晶工学ツールを使えば、作成した結晶格子の中にスペースを挿入したり、新規原子や分子全体を結晶内に配置したり、結晶格子を新たに設計することができます。 ▶︎動画：Placing a Molecule Into a Crystal

分子結晶ツール CrystalMaker に用意されている専用ツールを使えば、単位胞１つの中身を損なうことなく表示したり、個々の分子を単離したり、非対称単位を表示することができます。断片になった分子を修復し、ある原子に隣接する原子に沿ってプロット範囲を広げることで、複雑さの中から正しい判断を導き出すことができます。 ▶︎動画：Working with Molecular Crystals

ボリューメトリックデータの可視化

現在の構造に任意数の 3D データセットを組み合わせて表示することができます。データセットのそれぞれには個別の視覚設定を行うことができます。インポートできる可視化データは、テキストファイルや電子密度や細孔計算のプログラムで作成されたファイルです。

Smb6の電荷密度（Charge density）の可視化例／半透明で重ねた密度の一部を切り取り、その下にある結晶構造を表示	安息香酸の電子密度（Electron density）をシミュレーションし、（001）面に投影した例
銅構造の細孔を可視化した例	GaussianのCUBEファイルをインポートして、グラデーションの等値面として表現した電荷密度の例

結晶と分子を素早く新規作成

CrystalMakerを使えば、どのような種類の結晶や分子構造でも素早く簡単に構築することができます。結晶学の面倒さは、組み込みの対称性操作機能と洗練された空間群ブラウザで解消され、全ての結合と多面体は、プログラムによって自動的に生成されます。分子の構築も同様に簡単です（ポイント＆クリックで原子と結合を追加します）。Relaxコマンドを使えば、作成した構造のエネルギーを最小化して最適化することができます。

　　

CrystalMakerのモデルタイプには、トラディショナルな “ball-and-stick” をはじめ、space-filling（空間充填）、polyhedral（多面体）、wireframe（ワイヤーフレーム）、thermal ellipsoids（熱振動楕円体）といった広範な種類が用意されています。いずれのモデルタイプも細部にわたりカスタマイズできます。表示オプションによって、フォトリアリスティックなグラフィックにしたり、シンプルなラインアートにすることができます。連続的するプロット範囲を設定すれば、数百万にもおよぶ原子、結合、多面体を描画できます。

3Dグラフィック機能

CrystalMaker には、高画質で高速なピクセルパーフェクトなグラフィックで重なり補正と透過を実現する業界をリードする 3D グラフィクスが装備されています。印刷品質のグラフィックを透明度付きで保存したり、回転する魅力ある構造やアニメーションをビデオに保存できます。

同一の結晶内の異なる原子に異なる多面体スタイルを適用した例	原子ベクトル
曲面で構成された凹状の多面体	半透明の多面体の頂点に楕円体を表示した例

リアルタイムの操作環境 マウスをクリック＆ドラッグしたり、キーボードやツールバーを使用できます。格子ベクトル又は平面の法線と並行に表示できます。トラックパッド、 タッチバーによるマルチタッチ回転や縮尺を利用できます。 Windows版では Leap Motion Controllerを使用すると空間内でシンプルなハンドジェスチャーを利用できます。 Mac版では、タッチバーインターフェースがサポートされます。専用のタッチダイヤル、方向プリセット、およびスライダーを使用して回転とズームを行うことができます。 ▶︎動画：Using the Leap Motion Controller

多構造アニメーション 複数のファイル（または単一の多構造ファイル）を同一ウィンドウにドラッグ＆ドロップしたら、表示される構造のサムネイルをアニメーションのフレームとして並び替えるだけです。複数の表示内容を操作して同期させ、サムネイルをドラッグ＆ドロップして順番を変更したら、再生ボタンをクリックしてアニメーションを表示させることができます。 さらに、アニメーションを回転したり縮尺したり、モデルタイプを変更したり、表示方向やモデル設定を変更することもできます。また、プレイバックコントロールを使って、アニメーションシーケンスを「スクラブ」し、シミュレーションの軌跡を素早く確認することもできます。作成したアニメーションは、ウェブやプレゼンテーション用に利用できるムービーとしてエクスポートできます。 ▶︎動画：Creating an Animation

説得力のある教材の作成

CrystalMakerのドキュメントには、複数の構造を保存することができます。保存された各構造はグラフィカルなサムネイルであらわされます。構造上の挙動やアニメーションとして活用できることはもちろんですが、同じ構造の異なるビュー、異なるモデルタイプ、原子範囲、関連する構造について保存することもできます。どの構造にも個別のノートを付けられます。これらを 3D 回転モデルとともにインタラクティブなスライドショーとして文脈に従って提示することで、教育用として理想的なツールになります。プログラムには、魅力的な教材の作成例が同梱されています。
（例：”Building Quartz”, “Building Spinel”）

◆さらに詳しく　→　https://www.hulinks.co.jp/software/crystalmaker/

商品詳細

動作環境	《Win》Windows 7/8/10/11（64bit）／HD空き容量：1GB以上／RAM：4GB以上 ※OpenGL 4.1対応グラフィックスカード/.NET Frameworks 4.8以上 《Mac》Intel Macまたは Apple Silicon／mac OS 10.14/10.15/11/12/13/14／HD空き容量：1GB以上／RAM：8GB以上 ※動作環境の詳細：https://www.hulinks.co.jp/software/crystalmaker/#requirement

●画面から結晶が飛び抜けるような3Dステレオ画像もボタンひとつで作成●さまざまな種類の結晶や分子構造も素早く構築●作業には、対称性の組込み機能や高度な空間群エクスプローラを利用し、作成したい結合や多面体もプログラムが自動的に生成●分子構造の構築は、マウスをポイント＆クリックして原子と結合を追加するだけの簡単操作●サポートされる30種類を超えるフォーマット（CIF、PDB-Protein Data Bank-、SHELX、VASP等）のデータをインポート●出力オプション：構造データ、結合距離、配位環境、Webページの保存●操作結果をリアルタイムに確認しながら、結晶構造データを編集したり新たに一から構築●トラックパッド、 タッチバー（MacBook Proモデル）によるマルチタッチ回転や縮尺を利用したり、Leap Motion Controllerを使用して空間内でシンプルなハンドジェスチャーを利用可能●別売りのCrystalDiffractとSingleCrystalを追加することで粉末回折と電子線回折パターンのシミュレーションが可能●多数の構造データ利用可能（製品同梱：1,000～、開発元サイト：10,000～）●簡易日本語マニュアルPDF付き●ダウンロード版

【インストール条件・購入条件】
●Personalライセンス：1名のユーザ（注文時に指定された「エンドユーザー」）に対して使用権を付与／同一のユーザ使用に限り、複数のPCにインストール可能（同時起動不可）●個人用ライセンスのため、エンドユーザー以外が使用した場合はライセンス違反となるので注意●インストールは購入時に指定したプラットフォーム（WinまたはMac）に固定●研究室等、1つのグループに付与するライセンスについては別途お問い合わせ

販売元： ヒューリンクス
URL：https://www.hulinks.co.jp/

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