PRIMER 8
多くの海洋コミュニティーや生物多様性研究者が使用する多変量解析ソフトです。多変量データの統計分析に使用（例：種群集、物理化学変数、遺伝、微生物、バイオマーカー、食物、RS モデルデータ）油田、放電、鉱業、トロール漁業（網）、水産養殖などの環境影響の査定分析としても使用されています。PRIMERのアドオン「PERMANOVA+」とのセットもあります。
v8 2026年6月17日発売
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00700016
PRIMER 8 Lite（利用期間：12か月）
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¥ 99,000
本体価格 ¥ 90,000
※ Individual
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00700017
PRIMER 8 with PERMANOVA+（利用期間：12か月）
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¥ 124,300
本体価格 ¥ 113,000
※ Individual
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00700018
PRIMER 8 Lite（利用期間：12か月）
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¥ 39,600
本体価格 ¥ 36,000
※ Individual
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00700019
PRIMER 8 with PERMANOVA+（利用期間：12か月）
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¥ 49,500
本体価格 ¥ 45,000
※ Individual
価格は予告なく変更される場合があります。
インストール条件については、各ソフトウェアの利用許諾書を必ずご覧ください。
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- 製品特徴
主要なノンパラメトリックツールをすべて搭載したパッケージ
PRIMER Lite
エクスプローラーツリーとワークフロー
複数のデータセットを同時に操作したり、複数のグラフィックや出力ファイル間でフォーカスを切り替えたりすることが、すべて単一のインタラクティブで直感的なグラフィカルなWindows環境内で可能です。サンプルや変数の重要なサブセットを特定できます。大規模なデータセットも処理できます（利用可能なメモリ容量のみに制限されます）。指定した基準に基づいてデータをマージまたは分割できます。テストや表示のためのグループ構造を定義できます。ガイド付きワークフローで作業を追跡し、分析パスウェイを再現し、カスタムノートを作成し、PRIMERワークスペースのエクスプローラーツリーナビゲーションペインを使用してアイデアを簡単に共有できます。
マトリックス表示／ヒートマップ
組み込みのウィザードやシェードプロットツールを使用して、マトリックス表示やヒートマップを作成し、データ値を直接視覚化できます。サンプルや変数を個別に並べ替えるための豊富なオプションから選択できます。プロットの各軸に沿って系列パターンを最大化したり、グループ、補助変数、またはクラスターデンドログラムで制約したりできます。さまざまな基準に基づいて、全体的な変換を適用したり、種セットを削減して選択した数の変数のみを保持したりできます。2Dまたは3D表示の色、シンボル、ラベルオプションをカスタマイズできます。
クラスター分析
階層的凝集型クラスタ分析を、リンク方式（シングル、完全、グループ平均、またはフレキシブルベータ）を選択して実行します。デンドログラム、コフェネティック距離を生成し、各ノードで実行されるSIMPROFテストによって有意な残存構造を持つクラスターを特定します。SIMPROFの結果に基づいてファクターを作成します。分割型クラスタリングのオプションには、制約なし（UNCTREE）または制約あり（LINKTREE）の方法があります。指定されたグループ数に対してノンパラメトリックk平均クラスタリング（kRCLUSTER）を実行するか、自動SIMPROFカットオフ基準によってグループを選択できるようにします。
主成分分析（PCA）
組み込みのウィザードやシェードプロットツールを使用して、マトリックス表示やヒートマップを作成し、データ値を直接視覚化できます。サンプルや変数を個別に並べ替えるための豊富なオプションから選択できます。プロットの各軸に沿って系列パターンを最大化したり、グループ、補助変数、またはクラスターデンドログラムで制約したりできます。さまざまな基準に基づいて、全体的な変換を適用したり、種セットを削減して選択した数の変数のみを保持したりできます。2Dまたは3D表示の色、シンボル、ラベルオプションをカスタマイズできます。
多次元尺度構成法（MDS）
選択した次元で点間の距離の構成を作成し、複数の初期ランダム構成から反復多次元尺度構成法を使用して、元の非類似度（またはそのランク）に一致させて、全体的な最小ストレス解を特定します。 PRIMER 8 では、メトリック (mMDS)、閾値メトリック (tmMDS)、または非メトリック (nMDS) のフレーバーが提供され、ラベルとシンボルをカスタマイズしたり、画像、クラスター、バブル、デンドログラム、軌跡、ベクトルなどを重ねたりするための豊富なオプションがあります。ブートストラップを使用して、MDS プロットで平均化されたデータの信頼領域を表示します。2 次元および 3 次元の順序付けを回転、反転、拡大、回転、シーケンス、アニメーション、保存、共有します。
アノシム（ANOSIM）
多変量サンプル（因子のレベル）の事前グループ間の差異を、 R統計量を用いて順位の非類似度に基づいて検定するノンパラメトリック検定である類似性分析（ANOSIM）を搭載しています。p値はすべて、適切な制約や、完全な設計のコンテキスト内で任意の因子に対する置換可能な単位の選択を含む、厳密な順列法を用いて算出されます。最大3つの因子が交差または入れ子関係にある設計において、順序付き因子または順序なし因子を検定できます。このような機能を持つソフトウェアは他にありません。
多様性分析
種ごとのサンプルデータに対して、種数（S）、総個体数（N）、マルガレフの種数、ピエロウの均等度（J'）、ブリルアン（H）、フィッシャーのアルファ、シャノン（H'）、シンプソンの均等度/優占度、ヒルの多様性指数、希少化率など、一連の多様性指数を計算します。個体数またはバイオマスについて、SAD曲線または優占度プロットを作成します。分類群間の分類学的、系統発生学的、または機能的関係を組み込んで、平均特異度（AvTD、Delta+、Phi+）、総特異度（TTD、PD）、または特異度の変動（VarTD、Lambda+）を計算します。ランダム化を使用して、漏斗図または楕円図を作成し、地域リストまたはマスターリストからの代表性を評価します。
単変量ノンパラメトリック検定
ウィルコクソン符号順位検定、マン・ホイットニーU検定、クラスカル・ウォリス検定、コルモゴロフ・スミルノフ検定、または二変量関連性検定など、全く新しい一連のノンパラメトリック単変量統計検定を実行できます。PRIMERにおけるこれらの検定の実装は、推論に堅牢な順列アルゴリズムを使用し、関連するグラフを自動的に出力するという点で画期的です。
PRIMER 8 Liteの機能に加え、複雑な多因子設計、階層モデル、ランダム効果／混合効果を処理
PRIMER 8 with PERMANOVA+
PERMANOVA
順列多変量（または単変量）分散分析（PERMANOVA）を使用すると、選択した類似度尺度に基づいて、複雑な多因子実験/サンプリング設計に応じて高次元データの変動を分割できます。固定因子またはランダム因子、階層設計、共変量など、完全な設計が与えられた場合、堅牢な順列アルゴリズムを使用して、モデルの各項に対して正しい擬似F統計量を構築し、厳密なP値を取得します。バージョン8で異質分散を許可したり、有限母集団から抽出された因子を含めるオプションを追加したりするなど、主要な新機能を取り入れたPRIMERのPERMANOVAは、これらすべてをわずか数回のクリックで実現できる唯一のソフトウェアです。
複数の比較／対比
PERMANOVA分析に続いて、実験計画／サンプリング計画の枠組みに厳密に対応できる適切なペアワイズ比較を実施してください。有効な検定を行うのに十分な順列がない場合は、厳密なモンテカルロ推定P値を取得できます。特定の因子レベルまたは因子レベルのセットを比較するために、独自のコントラストを作成することも可能です。PERMANOVAを使用すれば、特定の仮説に合致する、正確かつ適切な分析を主導的に構築できます。
重心プロット
生データの順序付けは、見づらく、情報量が少ない場合があります。これは、残差（小規模な）変動が一般的に非常に大きいためです。主効果や交互作用セルの重心プロットを使用して、研究における最も重要な要因とそれらの相互作用について、有益な俯瞰図を作成してください。
PERMDISP
選択した類似度尺度に基づき、グループ間の多変量分散（ベータ多様性）に差がないという帰無仮説を検定します。比較対象グループを識別する因子を指定し、p値を表から取得するか、残差の順列を使用して取得するかを選択し、順列の数を指定します。オプションで、ペアワイズ検定の結果、またはサンプル単位のグループ重心（および／または平均値）に対する個々の偏差値をワークシートに出力して、後でグラフ化することもできます。
距離
選択した類似度尺度（DISTLM）に基づいて線形モデル（多変量重回帰）を適合させます。モデルに含める予測変数と適合順序を指定するか、選択手順（前方選択、後方選択、ステップワイズ選択、または「最適」選択）と選択基準（R^2、調整済みR^2、AIC、AICc、またはBIC）を選択してモデル選択を実行します。縮小モデルの下で残差の順列を使用してp値を取得し、周辺検定または逐次条件付き検定を実行します。最終的なモデル適合に関連付けられたdbRDAプロットを確認します。
RDA / dbRDA
非類似度に基づく冗長性分析（dbRDA）は、DISTLMから適合した変動を示す順序付け軸を生成します。dbRDA順序付け上に予測変数をベクトルとして表示します。ユークリッド距離行列に基づいてdbRDAを実行することで、古典的なRDAを実現します。
CAP / PCO
非類似度に基づく冗長性分析（dbRDA）は、DISTLMから適合した変動を示す順序付け軸を生成します。dbRDA順序付け上に予測変数をベクトルとして表示します。ユークリッド距離行列に基づいてdbRDAを実行することで、古典的なRDAを実現します。
多変量管理図
非類似度に基づく多変量管理図を実装します。新しいサンプル点（監視コンテキストなど）が、以前の（管理状態にある）観測値の参照セットと比較して「管理状態にある」か「管理状態外にある」かを判別します。初期管理図サンプルの数と管理図の種類（プログレッシブ、固定ベースライン、または移動ウィンドウ）を選択します。アルファレベルと管理図の上限値の種類（ノンパラメトリックまたはパラメトリック）を指定します。ロバストなノンパラメトリック上限値は、順列分布の分位数から取得されます。高次元システムに対して収縮を適用するかどうかを選択します。
Macintosh
Hybrid
Linux
Unix
Android
iOS